Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc169Q8BXX9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms