Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN7

Ppm1k, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1kQ8BXN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppm1kQ8BXN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppm1kQ8BXN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppm1kQ8BXN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms