Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trerf1Q8BXJ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trerf1Q8BXJ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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