Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx17Q8BVL3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx17Q8BVL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx17Q8BVL3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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