Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssc5dQ8BV57 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssc5dQ8BV57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms