Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup54Q8BTS4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms