Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efemp1Q8BPB5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efemp1Q8BPB5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efemp1Q8BPB5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp1Q8BPB5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms