Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
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Tcaf1Q8BNE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tcaf1Q8BNE1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tcaf1Q8BNE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Tcaf1Q8BNE1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf1Q8BNE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Tcaf1Q8BNE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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