Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem87bQ8BKU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem87bQ8BKU8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem87bQ8BKU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms