Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp1Q8BJQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Usp1Q8BJQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Usp1Q8BJQ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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