Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcal1Q8BJL0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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