Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo28Q8BIG4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo28Q8BIG4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms