Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra5Q8BHJ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra5Q8BHJ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms