Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Susd4Q8BH32 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Susd4Q8BH32 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms