Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe23Q8BGW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms