Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms