Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Htatsf1Q8BGC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms