Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnpo1Q8BFY9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnpo1Q8BFY9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms