Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmem39bQ810L4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem39bQ810L4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms