Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed4Q80WQ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed4Q80WQ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms