Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
AknaQ80VW7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AknaQ80VW7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
AknaQ80VW7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AknaQ80VW7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms