Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sestd1Q80UK0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms