Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Otop3Q80UF9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms