Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag8Q80UF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sdccag8Q80UF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdccag8Q80UF4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms