Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cep170bQ80U49 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cep170bQ80U49 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cep170bQ80U49 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms