Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec16aQ80U30 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clec16aQ80U30 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec16aQ80U30 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms