Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vat1lQ80TB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vat1lQ80TB8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vat1lQ80TB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms