Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna12Q80SS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms