Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo1Q7TT28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo1Q7TT28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms