Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnf1Q7TSH7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms