Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccp110Q7TSH4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccp110Q7TSH4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms