Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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