Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms