Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc93Q7TQK5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc93Q7TQK5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms