Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prrc2bQ7TPM1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prrc2bQ7TPM1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms