Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letm2Q7TNU7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letm2Q7TNU7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms