Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf1Q7TND5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms