Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd1l2Q7TN88 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd1l2Q7TN88 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd1l2Q7TN88 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms