Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shq1Q7TMX5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shq1Q7TMX5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms