Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcl2Q78Y63 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms