Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snd1Q78PY7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snd1Q78PY7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms