Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nme8Q715T0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms