Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nemp1Q6ZQE4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nemp1Q6ZQE4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nemp1Q6ZQE4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.1 ms