Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinlQ6ZQ12 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinlQ6ZQ12 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms