Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rhox8Q6VSS7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rhox8Q6VSS7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Rhox8Q6VSS7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rhox8Q6VSS7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms