Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ift172Q6VH22 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift172Q6VH22 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift172Q6VH22 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms