Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms