Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GcsamQ6RFH4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms