Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a3Q6PIC6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 348.5 ms