Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx13Q6PHS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx13Q6PHS6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms